2021年南京农业大学携手国内15个高校和科研院所研发的中国淡水大型底栖无脊椎动物条形码数据库,经过多年的数据积累、数据库功能开发和网络开放使用功能研发与优化后正式对外开放http://cfmlib.njau.edu.cn/(数据库注册使用等事宜,请联系wmeng@njau.edu.cn)。

亮点1:COI条形码和线粒体基因组信息明显增加
数据库已上传条形码物种:2645种,条形码数量:4785条,线粒体基因组:341个。数据库整合了同一物种的分类、分子条形码、地理分布以及不同虫态形态图像等信息,有利于物种的精准鉴定。同时支持分类阶元、关键词、地理分布等三种不同方式的信息检索,支持按筛选条件检索和结果排序,方便用户查找需要的数据资源。

亮点2:一站式分子鉴定及分析功能
数据库为单个物种条形码信息比对和分析提供了平台,在搜索框中输入fasta格式文件或者需要查询的序列,经过BLAST比对,得到按相似度排列的分子鉴定结果。分子鉴定不仅可以在该数据库内进行比对鉴定,也可以跨平台选择下载至本底的GenBank、BOLD等公共数据库同时进行分子鉴定。数据库配备的小工具:Muscle、GeneWise、LASTZ、Compare等可辅助使用者进一步进行生信分析。

亮点3:高效且操作简便的环境DNA-宏条形码数据在线分析模块
环境DNA宏条形码数据的处理需要经过繁琐的序列拼接、质量控制、标签分流、OTU聚类以及物种注释等步骤,每一步需要使用不同的软件和代码。为了方便宏条形码数据的处理分析,数据库开发了一个简便易懂的宏条形码数据自动分析模块,在原有OTU聚类分析模块的基础上,增加了ASV分析模块。数据库分析界面直观友好,只需两步操作,就可以得到数据的鉴定注释结果。该数据库通过大量实际数据测试显示,其对宏条形码数据的注释效果无论在注释准确度还是注释的精度上明显优于公共参考数据库。

编:王 萌
校:唐莉栋
审:许承保