仪器名称：四极杆静电场轨道阱超高分辨液质联用仪

品牌：Thermo

型号：Orbitrap Exploris 480

购置时间：2020年

放置地点：21-139

管理人员：宋炜

主要技术参数：

1、质量范围：m/z 40–6000；

2、最高分辨率：480,000（在 m/z 200 处）；

3、最高扫描速度：40 Hz（在分辨率为 7,500 时）；

4、质量准确度：外标法：< 3 ppm RMS（24 小时内漂移），内标法：< 1 ppm RMS（24 小时内漂移）；

5、灵敏度：MS/MS 灵敏度：50 fg 利血平，柱上信噪比（S/N）≥ 100:1；SIM 灵敏度：50 fg 利血平，柱上信噪比（S/N）≥ 150:1；

6、单张 Orbitrap 质谱图内动态范围：> 5,000:1；

7、极性切换速度：> 1.4 Hz（包括正离子和负离子全谱扫描）。

应用方向和案例：

主要用于分析热稳定性差、极性强、分子量高的物质，如不能用气相色谱-质谱分析的生物样品（药物及其代谢物），生物大分子（肽、蛋白质、核酸和多糖）。

1、植物蛋白质组学应用

（1）蛋白质定位与相互作用分析

Orbitrap Exploris 480能够对植物样本进行细胞和亚细胞水平的蛋白质定位分析，典型案例：追踪蛋白在细胞器中的分布及蛋白间相互作用。

典型案例：《Molecular & Cellular Proteomics》上的一篇文章利用exploris 480对小麦种子发芽过程中的蛋白质组进行定量分析，鉴定了与种子萌发相关的关键蛋白质，揭示了种子萌发的分子机制。

（2）翻译后修饰研究

该系统在植物蛋白质翻译后修饰（如磷酸化、泛素化）分析中表现突出。

典型案例：上海逆境生物学研究中心利用磷酸化组学技术，揭示了植物雷帕霉素靶蛋白（TOR）激酶与脱落酸（ABA）受体通过磷酸化修饰调控植物胁迫应答的机制。此外，泛素化修饰的研究也帮助解析了乙烯介导的花瓣衰老过程中蛋白质降解的动态过程。

（3）高通量定量蛋白质组学

结合DIA（数据非依赖采集）和FAIMS（高场不对称波形离子迁移谱）技术，Exploris 480可实现大规模植物样本的高通量分析。

典型案例：Evosep One液相系统与FAIMS-Exploris 480联用，可在短梯度（如21分钟）内鉴定超过5000个蛋白质，显著提升分析效率，适用于植物突变体库或环境胁迫响应的大规模研究。

2、植物脂质组学研究

研究植物脂质在生长发育和信号转导中的作用。

典型案例：《Plant Physiology》上的一篇文章利用exploris 480对油菜花粉管生长过程中脂质组成的变化进行分析，发现磷脂和固醇类物质在花粉管延伸中的重要作用。

3、多组学联合分析

该系统在整合蛋白质组、代谢组和转录组数据方面具有独特优势。

典型案例：玉米缺氮胁迫研究中，研究者利用Orbitrap Exploris 480结合代谢组和转录组数据，揭示了自噬作用对细胞稳态的调控机制。通过多组学分析，发现自噬对蛋白质组的调控比缺氮胁迫本身更为显著。